Député à l'Assemblée Nationale (1997-2002), Ebénézer Njoh Mouelle publie Député de la nation en 2002 et partage ses activités entre l'intérêt pour les questions politiques, l'animation du Cercle Camerounais de Philosophie qu'il a fondé en 1995 et la poursuite de son travail proprement philosophique ( sept livres) avec un champ d'intérêt ouvert sur le transhumanisme et l'intelligence artificielle.
Il participe à l'équipe gouvernementale (2006-2007), organise des événements intellectuels tel le colloque international sur « La philosophie et les interprétations de la mondialisation en Afrique (novembre 2007) et représente le Cameroun au Conseil Exécutif de l'Unesco ( dernier mandat achevé en novembre 2019).